Chapitre 1 — Assassination Time
En mars d'une certaine année, une mystérieuse créature tentaculaire d'origine inconnue détruit plus de 70% de la lune, annonçant qu'elle détruira le monde de la même manière dans un an. Après plusieurs tentatives d'assassinat infructueuses en raison de sa vitesse de Mach 20, la créature conclut un accord avec le gouvernement pour devenir le professeur de la classe 3-E du collège Kunugigaoka, dont les élèves reçoivent des armes spécialement conçues pour blesser la créature et se voient offrir une récompense de 10 milliards de yens à celui qui parviendra à l'assassiner avant la remise des diplômes. Bien que les élèves soient généralement frustrés par leurs tentatives d'assassinat infructueuses, ils découvrent que la créature est un professeur respectable à sa manière. Un groupe d'élèves implique Nagisa Shiota, un garçon qui ne s'estime pas beaucoup, dans leur plan, dans lequel ils lui fixent une grenade remplie de billes tueuses de créatures et la font exploser à portée. Cependant, à ce moment-là, la créature mue, protégeant à la fois elle-même et Nagisa de l'explosion, menaçant les autres élèves de ne plus utiliser de plans qui nuisent aux autres, tout en admirant les efforts de Nagisa. Pour correspondre à la nature apparemment invincible de leur professeur, sa camarade de classe Kaede Kayano donne à la créature le nom approprié de « Koro-sensei ».